色素提取分離設備主要應用在色素的生產，通過合理的應用能提高色素的收得率，去除副染料及小分子雜質，降低生產成本。色素提取分離設備能將大分子懸浮物及蛋白進行截留，讓澄清的色素提取液滲透通過膜進行滲透液側。且在過濾時水及部分小分子雜質通過膜，色素組分則被截留濃縮。

    其實，色素提取分離設備的分離原理很簡單，色素能溶解在層析液中，但由于不同的色素在層析液中的溶解度不同，隨層析液在濾紙上的擴散快慢不同，從而達到分離色素的效果。一般情況下，色素提取分離設備在分離色素時，溶解度較高的色素，隨層析液在濾紙上的擴散速度快；反之，溶解度較低的色素，隨層析液在濾紙上的擴散速度慢。

    如果色素提取分離設備要從中綠體中提取綠色素，由于色素可溶到有機溶劑，所以可用無水乙醇等有機溶劑提取色素。色素在層析液中的溶解度不同，在濾紙上的擴散速度也有差別，可分來進行分離色素。